自序一自序二卷上外症用刀针法火针不可轻用治筋缩法治足筋缩法浮皮兜脓须剪开升药所忌背部湿痰块痔漏疮鸡胸症龟背症虚人有病易昏愦病挟气郁宜审治少壮妇女病要法治孕妇病法时疫捷法（先看两肩有红点）产后治法大略温
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
自叙卷上·经络脏腑无气存亡论躯壳经络脏腑论表里上下论阴阳升降论治病必分经络脏腑论治病不必分经络脏腑论肾藏精论一脏一腑先绝论君火相火论卷上·脉诊脉决死生论症脉轻重论脉症与病相反论卷上·病中风论臌膈论寒热
仁斋直指方论
序内消法一艾灸法二神火照法三刀针砭石法四围药法五开口除脓法六收口法七总论服药法八详论五善七恶救援法九将息法十外科症治方药发背脑疽鬓疽井口疽疔疮喉痹缠喉风缠舌喉风乳蛾舌衄悬痈（一）腮痈喉疮走马牙疳喉瘤茧
太阳证发热（长期低热）太阳证偏头痛（三叉神经痛）太阳证眩晕（美尼尔氏综合症）太阳证咳嗽支气管扩张急性肺炎太阳证哮喘太阳证刚痉（临产麻疹）太阳证柔痉太阳证风湿太阳证历节病（风湿性关节炎）太阳证风寒湿痹风
卷上胎前恶阻子烦子悬子肿子满子气子喑子痫子淋子嗽子疟心腹痛腰胁痛下血尿血转胞胎气上逼脏躁胎动胎痛孤浆吐血伤寒痢疾泄泻霍乱伤食盅鸣堕胎胎不长鬼胎伤胎肠覃石瘕卷中产后难产胎衣不下血晕厥恶露不下恶露不绝血崩
序自序卷一卷二卷三卷四
卷上卷下
序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇